O CEM tem objetivos definidos para cada área de atuação:

Na área de PESQUISA:

- Analisar as mudanças em curso nas metrópoles e avaliar os seus efeitos através de novas abordagens conceituais e metodológicas;
- Atuar como centro de referência para documentação e consolidação de informações e estudos sobre a Região Metropolitana de São Paulo e outras metrópoles;
- Atuar em novas pesquisas sobre questões metropolitanas e estimular comparações entre as metrópoles nacionais e mundiais.
- Sustentar e atualizar um Sistema de Informações Geográficas (SIG) com informações socioeconômicas, ambientais, políticas e culturais sobre as regiões metropolitanas.

Na área de TRANSFERÊNCIA:

- Constituir um Sistema de Informações Geográficas (SIG) com dados espacializados, para uso de planejadores urbanos e formuladores de políticas públicas;
- Sistematizar, consolidar e disseminar informações sobre diferentes experiências no campo das políticas públicas; ser um centro multiplicador nessa área;
- Desenvolver aplicativos próprios para integrar dados de diversas origens;
- Treinar profissionais para o uso de dados georreferenciados na formulação e implementação de políticas públicas urbanas.
- Atuar como um centro de difusão de diagnósticos, indicadores e aplicativos para a compreensão e o uso de dados espacializados.


Na área de DIFUSÃO:

- Divulgar informações sobre a metrópole por meio de produtos audiovisuais e atividades culturais programadas.